Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD180Q99467 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD180Q99467 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD180Q99467 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD180Q99467 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD180Q99467 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD180Q99467 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CD180Q99467 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD180Q99467 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD180Q99467 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD180Q99467 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD180Q99467 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD180Q99467 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD180Q99467 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD180Q99467 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD180Q99467 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD180Q99467 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD180Q99467 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD180Q99467 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD180Q99467 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD180Q99467 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD180Q99467 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD180Q99467 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD180Q99467 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD180Q99467 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD180Q99467 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD180Q99467 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD180Q99467 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD180Q99467 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD180Q99467 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD180Q99467 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD180Q99467 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD180Q99467 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD180Q99467 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD180Q99467 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD180Q99467 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD180Q99467 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD180Q99467 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD180Q99467 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD180Q99467 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD180Q99467 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD180Q99467 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD180Q99467 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD180Q99467 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD180Q99467 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD180Q99467 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD180Q99467 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CD180Q99467 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD180Q99467 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD180Q99467 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD180Q99467 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD180Q99467 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD180Q99467 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD180Q99467 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD180Q99467 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD180Q99467 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD180Q99467 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD180Q99467 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD180Q99467 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD180Q99467 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD180Q99467 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD180Q99467 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD180Q99467 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD180Q99467 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD180Q99467 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD180Q99467 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD180Q99467 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD180Q99467 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CD180Q99467 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD180Q99467 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD180Q99467 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD180Q99467 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD180Q99467 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD180Q99467 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD180Q99467 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD180Q99467 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD180Q99467 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD180Q99467 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD180Q99467 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD180Q99467 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD180Q99467 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD180Q99467 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD180Q99467 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD180Q99467 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD180Q99467 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD180Q99467 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD180Q99467 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD180Q99467 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD180Q99467 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD180Q99467 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD180Q99467 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD180Q99467 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CD180Q99467 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CD180Q99467 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD180Q99467 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD180Q99467 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CD180Q99467 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD180Q99467 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD180Q99467 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD180Q99467 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms