Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KC1Q96S38 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms