Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC9Q96Q05 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms