Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL15Q96M94 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL15Q96M94 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL15Q96M94 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL15Q96M94 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL15Q96M94 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL15Q96M94 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL15Q96M94 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL15Q96M94 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL15Q96M94 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL15Q96M94 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL15Q96M94 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms