Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIPA1Q96FS4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms