Protein–RNA interactions for Protein: Q96DV4

MRPL38, 39S ribosomal protein L38, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL38Q96DV4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL38Q96DV4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MRPL38Q96DV4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL38Q96DV4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL38Q96DV4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL38Q96DV4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL38Q96DV4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL38Q96DV4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL38Q96DV4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL38Q96DV4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL38Q96DV4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL38Q96DV4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL38Q96DV4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL38Q96DV4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms