Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VTI1AQ96AJ9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
VTI1AQ96AJ9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms