Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP7Q93009 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP7Q93009 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP7Q93009 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP7Q93009 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP7Q93009 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP7Q93009 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP7Q93009 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP7Q93009 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP7Q93009 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP7Q93009 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP7Q93009 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP7Q93009 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP7Q93009 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP7Q93009 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP7Q93009 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP7Q93009 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP7Q93009 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP7Q93009 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP7Q93009 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP7Q93009 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP7Q93009 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP7Q93009 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP7Q93009 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP7Q93009 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP7Q93009 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP7Q93009 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP7Q93009 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP7Q93009 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP7Q93009 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP7Q93009 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP7Q93009 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP7Q93009 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP7Q93009 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP7Q93009 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP7Q93009 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP7Q93009 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP7Q93009 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP7Q93009 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP7Q93009 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP7Q93009 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP7Q93009 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP7Q93009 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP7Q93009 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP7Q93009 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP7Q93009 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP7Q93009 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP7Q93009 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP7Q93009 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP7Q93009 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP7Q93009 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP7Q93009 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP7Q93009 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP7Q93009 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP7Q93009 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP7Q93009 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP7Q93009 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP7Q93009 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP7Q93009 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP7Q93009 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP7Q93009 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP7Q93009 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP7Q93009 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP7Q93009 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP7Q93009 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP7Q93009 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP7Q93009 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP7Q93009 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP7Q93009 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP7Q93009 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP7Q93009 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP7Q93009 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP7Q93009 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP7Q93009 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP7Q93009 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP7Q93009 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP7Q93009 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP7Q93009 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP7Q93009 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP7Q93009 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP7Q93009 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP7Q93009 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP7Q93009 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP7Q93009 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP7Q93009 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP7Q93009 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP7Q93009 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP7Q93009 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP7Q93009 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP7Q93009 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP7Q93009 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP7Q93009 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP7Q93009 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP7Q93009 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP7Q93009 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP7Q93009 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP7Q93009 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP7Q93009 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP7Q93009 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP7Q93009 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms