Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms