Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL2Q92772 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms