Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX19Q92543 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms