Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPDL3BQ92485 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMPDL3BQ92485 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms