Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STAG1Q8WVM7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STAG1Q8WVM7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STAG1Q8WVM7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STAG1Q8WVM7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STAG1Q8WVM7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STAG1Q8WVM7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG1Q8WVM7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
STAG1Q8WVM7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms