Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KNL1Q8NG31 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNL1Q8NG31 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNL1Q8NG31 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms