Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEN9

PDZD8, PDZ domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD8Q8NEN9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms