Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCPH1Q8NEM0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MCPH1Q8NEM0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCPH1Q8NEM0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCPH1Q8NEM0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCPH1Q8NEM0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCPH1Q8NEM0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCPH1Q8NEM0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCPH1Q8NEM0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCPH1Q8NEM0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCPH1Q8NEM0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCPH1Q8NEM0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCPH1Q8NEM0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCPH1Q8NEM0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCPH1Q8NEM0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCPH1Q8NEM0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCPH1Q8NEM0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCPH1Q8NEM0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCPH1Q8NEM0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms