Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COLGALT1Q8NBJ5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COLGALT1Q8NBJ5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms