Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NHLRC2Q8NBF2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms