Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAU1

FNDC5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC5Q8NAU1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC5Q8NAU1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC5Q8NAU1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC5Q8NAU1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms