Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C3

TRIML2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML2, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML2Q8N7C3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIML2Q8N7C3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIML2Q8N7C3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms