Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXA5

SPACA3, Sperm acrosome membrane-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA3Q8IXA5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPACA3Q8IXA5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPACA3Q8IXA5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPACA3Q8IXA5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPACA3Q8IXA5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPACA3Q8IXA5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPACA3Q8IXA5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPACA3Q8IXA5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPACA3Q8IXA5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPACA3Q8IXA5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPACA3Q8IXA5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPACA3Q8IXA5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPACA3Q8IXA5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPACA3Q8IXA5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms