Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTN4Q8IWV2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN4Q8IWV2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms