Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB43Q86YS6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB43Q86YS6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms