Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PALB2Q86YC2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALB2Q86YC2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.1 ms