Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
PBRM1Q86U86 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
PBRM1Q86U86 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PBRM1Q86U86 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PBRM1Q86U86 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PBRM1Q86U86 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PBRM1Q86U86 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
PBRM1Q86U86 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PBRM1Q86U86 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PBRM1Q86U86 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PBRM1Q86U86 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PBRM1Q86U86 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
PBRM1Q86U86 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC39.51■■■■□ 3.92
PBRM1Q86U86 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
PBRM1Q86U86 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.91
PBRM1Q86U86 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
PBRM1Q86U86 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PBRM1Q86U86 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PBRM1Q86U86 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
PBRM1Q86U86 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
PBRM1Q86U86 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
PBRM1Q86U86 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
PBRM1Q86U86 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
PBRM1Q86U86 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PBRM1Q86U86 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
PBRM1Q86U86 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC39.48■■■■□ 3.91
PBRM1Q86U86 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
PBRM1Q86U86 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PBRM1Q86U86 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PBRM1Q86U86 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
PBRM1Q86U86 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PBRM1Q86U86 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
PBRM1Q86U86 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
PBRM1Q86U86 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
PBRM1Q86U86 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
PBRM1Q86U86 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.3 ms