Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMP0

THSD4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD4Q6ZMP0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
THSD4Q6ZMP0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THSD4Q6ZMP0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THSD4Q6ZMP0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THSD4Q6ZMP0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THSD4Q6ZMP0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THSD4Q6ZMP0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THSD4Q6ZMP0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
THSD4Q6ZMP0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THSD4Q6ZMP0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
THSD4Q6ZMP0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
THSD4Q6ZMP0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
THSD4Q6ZMP0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms