Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMD2

SPNS3, Protein spinster homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3Q6ZMD2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPNS3Q6ZMD2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPNS3Q6ZMD2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms