Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM20Q6UY09 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEACAM20Q6UY09 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEACAM20Q6UY09 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEACAM20Q6UY09 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEACAM20Q6UY09 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEACAM20Q6UY09 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEACAM20Q6UY09 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEACAM20Q6UY09 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEACAM20Q6UY09 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEACAM20Q6UY09 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEACAM20Q6UY09 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEACAM20Q6UY09 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms