Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TXNDC11Q6PKC3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TXNDC11Q6PKC3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms