Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CARMIL2Q6F5E8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CARMIL2Q6F5E8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CARMIL2Q6F5E8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
CARMIL2Q6F5E8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CARMIL2Q6F5E8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CARMIL2Q6F5E8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CARMIL2Q6F5E8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CARMIL2Q6F5E8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CARMIL2Q6F5E8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CARMIL2Q6F5E8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CARMIL2Q6F5E8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CARMIL2Q6F5E8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
CARMIL2Q6F5E8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CARMIL2Q6F5E8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CARMIL2Q6F5E8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CARMIL2Q6F5E8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CARMIL2Q6F5E8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CARMIL2Q6F5E8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
CARMIL2Q6F5E8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CARMIL2Q6F5E8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CARMIL2Q6F5E8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CARMIL2Q6F5E8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.7
CARMIL2Q6F5E8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms