Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV67

PPRC1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPRC1Q5VV67 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
PPRC1Q5VV67 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PPRC1Q5VV67 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PPRC1Q5VV67 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PPRC1Q5VV67 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PPRC1Q5VV67 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PPRC1Q5VV67 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PPRC1Q5VV67 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PPRC1Q5VV67 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PPRC1Q5VV67 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PPRC1Q5VV67 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PPRC1Q5VV67 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PPRC1Q5VV67 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
PPRC1Q5VV67 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PPRC1Q5VV67 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PPRC1Q5VV67 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PPRC1Q5VV67 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PPRC1Q5VV67 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PPRC1Q5VV67 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PPRC1Q5VV67 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PPRC1Q5VV67 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PPRC1Q5VV67 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PPRC1Q5VV67 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PPRC1Q5VV67 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms