Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT03

NUTM2D, NUT family member 2D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUTM2DQ5VT03 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NUTM2DQ5VT03 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NUTM2DQ5VT03 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
NUTM2DQ5VT03 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NUTM2DQ5VT03 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NUTM2DQ5VT03 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NUTM2DQ5VT03 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NUTM2DQ5VT03 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NUTM2DQ5VT03 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NUTM2DQ5VT03 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
NUTM2DQ5VT03 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NUTM2DQ5VT03 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NUTM2DQ5VT03 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NUTM2DQ5VT03 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NUTM2DQ5VT03 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
NUTM2DQ5VT03 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NUTM2DQ5VT03 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NUTM2DQ5VT03 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NUTM2DQ5VT03 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NUTM2DQ5VT03 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NUTM2DQ5VT03 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NUTM2DQ5VT03 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NUTM2DQ5VT03 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NUTM2DQ5VT03 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NUTM2DQ5VT03 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NUTM2DQ5VT03 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NUTM2DQ5VT03 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NUTM2DQ5VT03 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NUTM2DQ5VT03 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NUTM2DQ5VT03 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NUTM2DQ5VT03 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NUTM2DQ5VT03 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NUTM2DQ5VT03 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms