Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARHGAP40Q5TG30 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP40Q5TG30 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms