Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5Y3

CAMSAP1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP1Q5T5Y3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CAMSAP1Q5T5Y3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CAMSAP1Q5T5Y3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CAMSAP1Q5T5Y3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CAMSAP1Q5T5Y3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CAMSAP1Q5T5Y3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CAMSAP1Q5T5Y3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CAMSAP1Q5T5Y3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CAMSAP1Q5T5Y3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CAMSAP1Q5T5Y3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CAMSAP1Q5T5Y3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CAMSAP1Q5T5Y3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CAMSAP1Q5T5Y3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CAMSAP1Q5T5Y3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CAMSAP1Q5T5Y3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CAMSAP1Q5T5Y3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CAMSAP1Q5T5Y3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CAMSAP1Q5T5Y3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
CAMSAP1Q5T5Y3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CAMSAP1Q5T5Y3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CAMSAP1Q5T5Y3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CAMSAP1Q5T5Y3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CAMSAP1Q5T5Y3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CAMSAP1Q5T5Y3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CAMSAP1Q5T5Y3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CAMSAP1Q5T5Y3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CAMSAP1Q5T5Y3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CAMSAP1Q5T5Y3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CAMSAP1Q5T5Y3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CAMSAP1Q5T5Y3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CAMSAP1Q5T5Y3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
CAMSAP1Q5T5Y3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CAMSAP1Q5T5Y3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CAMSAP1Q5T5Y3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CAMSAP1Q5T5Y3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CAMSAP1Q5T5Y3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CAMSAP1Q5T5Y3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CAMSAP1Q5T5Y3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CAMSAP1Q5T5Y3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CAMSAP1Q5T5Y3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CAMSAP1Q5T5Y3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CAMSAP1Q5T5Y3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CAMSAP1Q5T5Y3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms