Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIVEP3Q5T1R4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIVEP3Q5T1R4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms