Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CEP170Q5SW79 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
CEP170Q5SW79 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CEP170Q5SW79 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
CEP170Q5SW79 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CEP170Q5SW79 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CEP170Q5SW79 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CEP170Q5SW79 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CEP170Q5SW79 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CEP170Q5SW79 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CEP170Q5SW79 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CEP170Q5SW79 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CEP170Q5SW79 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CEP170Q5SW79 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CEP170Q5SW79 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CEP170Q5SW79 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CEP170Q5SW79 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CEP170Q5SW79 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CEP170Q5SW79 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CEP170Q5SW79 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
CEP170Q5SW79 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.8
CEP170Q5SW79 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CEP170Q5SW79 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CEP170Q5SW79 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CEP170Q5SW79 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CEP170Q5SW79 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
CEP170Q5SW79 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms