Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB41Q5JT25 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB41Q5JT25 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB41Q5JT25 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB41Q5JT25 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB41Q5JT25 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB41Q5JT25 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms