Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDNFQ49AH0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDNFQ49AH0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms