Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
TWISTNBQ3B726 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TWISTNBQ3B726 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TWISTNBQ3B726 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TWISTNBQ3B726 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TWISTNBQ3B726 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TWISTNBQ3B726 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TWISTNBQ3B726 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TWISTNBQ3B726 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TWISTNBQ3B726 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TWISTNBQ3B726 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TWISTNBQ3B726 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TWISTNBQ3B726 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TWISTNBQ3B726 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TWISTNBQ3B726 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TWISTNBQ3B726 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TWISTNBQ3B726 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TWISTNBQ3B726 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TWISTNBQ3B726 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TWISTNBQ3B726 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TWISTNBQ3B726 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TWISTNBQ3B726 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms