Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LONRF1Q17RB8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LONRF1Q17RB8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
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