Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAM1Q15629 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAM1Q15629 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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