Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC41Q15345 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC41Q15345 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms