Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRAM2Q15035 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAM2Q15035 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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