Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC2Q13868 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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