Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PKD2Q13563 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PKD2Q13563 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms