Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLF1Q13351 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
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