Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTA1Q13330 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTA1Q13330 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTA1Q13330 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA1Q13330 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA1Q13330 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA1Q13330 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA1Q13330 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA1Q13330 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA1Q13330 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA1Q13330 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA1Q13330 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA1Q13330 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTA1Q13330 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTA1Q13330 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTA1Q13330 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTA1Q13330 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA1Q13330 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTA1Q13330 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
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