Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHAF1BQ13112 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
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