Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC41.34■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC41.33■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC41.32■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
PRDM2Q13029 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC41.23■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
PRDM2Q13029 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC41.19■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
PRDM2Q13029 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
PRDM2Q13029 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
PRDM2Q13029 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.17
PRDM2Q13029 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
PRDM2Q13029 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
PRDM2Q13029 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms