Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC15Q0P6D6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC15Q0P6D6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms