Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSC1Q08554 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSC1Q08554 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms